Intermediate Stockpile (ISP) dimiliki oleh Entitas Anak, yaitu MCT, berlokasi di sisi Sungai Mahakam yang digunakan untuk memindahkan batubara yang diangkut dari tongkang sungai ke tongkang laut. ISP dilengkapi dengan 4 tempat sandar khusus untuk menurunkan batubara dari tongkang sungai dan 1 tempat sandar untuk menaikkan batubara ke tongkang laut. Perseroan juga memiliki 1 tambahan tempat berlabuh yang dapat digunakan baik untuk menurunkan atau menaikkan muatan barang (non-batubara). ISP dilengkapi dengan infastruktur dan alat berat, seperti excavators, grab cranes, dozers, wheell loaders, conveyor belt dengan kapasitas 1.500 MT per jam, stockpile dengan kapasitas 230.000 MT serta fasilitas lainnya.